施工合同与招投标不一致时，按照招标文件和施工合同的先后顺序执行，以施工合同为准。招标文件中的专用合同条款需符合当事人真实意愿、不违反法律规定、不侵害他益。格式条款中免责、加重责任、排除主要权利的条款无效。
法律分析
施工合同与招投标不一致的，属于阴阳合同，按照招投标后经过备案的中标合同来确定各自权利义务。招标文件与施工合同在一般情况下权益与义务内容是一致的，但也有的由于多种因素的干扰导致招标文件与施工合同条款不一致，这时就要按照招标文件与施工合同出台的先后顺序执行，即：
招标文件在先，施工合同在后，因为招标文件，施工合同都是双方认可的，施工合同可以修改招标文件内容，故此工程结算时应当以施工合同为准。
招标文件中的专用合同条款也就是招标合同中的条款内容，该条款内容是否具有法律效力需要结合以下情况确定：
合同中的条款效力需要看是否双方当事人的真实意思表示，是否有违反国家法律规定的地方，以及是否侵害他人的权益。对于合同中提供格式条款一方免除责任、加重对方责任、排除对方主要权利的条款无效。
拓展延伸
解决招标文件与合同不一致问题的最佳实践
解决招标文件与合同不一致问题的最佳实践是通过以下步骤来进行：
1.仔细审查招标文件和合同：首先，对招标文件和合同进行详细的审查，比较两者之间的差异和不一致之处。
2.确定优先权：确定招标文件和合同之间的优先权，即哪个文件应该具有更高的法律效力。通常情况下，合同会优先于招标文件。
3.协商解决方案：与相关各方进行积极的沟通和协商，寻求解决方案。这可能涉及修改合同条款、重新谈判或调整招标文件。
4.寻求法律意见：如有必要，咨询专业律师以获取法律意见和建议，确保解决方案的合法性和有效性。
5.文档记录：在整个解决过程中，确保详细记录所有的沟通、协商和决策，以备将来可能出现的争议。
6.风险管理：评估解决方案的风险，并采取适当的措施来降低风险，例如签署补充协议或进行额外的审查程序。
7.审查流程改进：根据此次经验，审查招标文件和合同的流程，并进行必要的改进，以避免类似问题在将来的招标过程中再次发生。
通过以上最佳实践，您可以更好地应对招标文件与合同不一致问题，确保项目的顺利进行并避免潜在的法律风险。
结语
在处理施工合同与招投标不一致问题时，我们应当遵循以下最佳实践：仔细审查文件，确定优先权，协商解决方案，寻求法律意见，记录沟通和决策，进行风险管理，审查流程改进。通过这些步骤，我们能够有效解决问题，确保项目的顺利进行，并降低潜在的法律风险。
法律依据
《招标投标法》
第四十六条招标人和中标人应当自中标通知书发出之日起三十日内，按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同。招标人和中标人不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议。招标文件要求中标人提交履约保证金的，中标人应当提交。
第五十九条招标人与中标人不按照招标文件和中标人的投标文件订立合同的，或者招标人、中标人订立背离合同实质性内容的协议的，责令改正;可以处中标项目金额千分之五以上千分之十以下的罚款。
《中华人民共和国民法典》
第七百九十条建设工程的招标投标活动，应当依照有关法律的规定公开、公平、公正进行。
